小河蚌的食物主要包括单胞藻、原生动物和有机碎屑等。具体来说，它们会摄食如轮虫、鞭毛虫、绿眼虫等原生动物，以及绿粒藻、栅藻、舟形藻、甲藻、四角藻、纺锤硅藻、杆星藻等单胞藻类。

此外，小河蚌还会摄食甲壳动物的残屑及植物叶片等有机碎屑。其中，硅藻是它们较易消化的食物之一。