透明小水母主要以浮游生物为食，如浮游植物、浮游动物和小型鱼类。

在人工饲养的环境中，小水母可以吃虾仁、螃蟹肉、海水混合饲料、玻璃虫和鱼肉等食物。这些食物富含蛋白质和营养，能够满足小水母的生长需求。同时，小水母也可以吃豆苗和燕麦片。